學(xué)校于1939年起源于云南大學(xué)林學(xué)系。1958年8月，農(nóng)學(xué)系和林業(yè)系與云南大學(xué)分離，昆明農(nóng)林學(xué)院成立。學(xué)校位于昆明市北郊黑龍灘。經(jīng)過幾輪分離，以云南省林業(yè)學(xué)院為基礎(chǔ)，云南林學(xué)院成立于1973年，由原林業(yè)部直接領(lǐng)導(dǎo)，全國學(xué)生開放。
學(xué)校位于安寧市溫泉鎮(zhèn)。北京林學(xué)院于1978年決定搬回北京。前國家教育委員會(huì)和國家林業(yè)局批準(zhǔn)云南林業(yè)學(xué)院在原校區(qū)建立獨(dú)立學(xué)校，繼續(xù)辦學(xué)。 1983年10月，云南省林業(yè)學(xué)院經(jīng)原林業(yè)部批準(zhǔn)，更名為西南林學(xué)院。



1981年，成為國務(wù)院批準(zhǔn)的第一批碩士學(xué)位授予單位。原林業(yè)部于1985年批準(zhǔn)西南林學(xué)院搬遷，1990年遷至現(xiàn)址學(xué)校（云南省昆明市白龍寺300號(hào)）。自2000年9月以來，西南林學(xué)院以云南省為主體，已納入云南省經(jīng)濟(jì)建設(shè)，社會(huì)發(fā)展和高等教育發(fā)展總體規(guī)劃，享受與省級(jí)大學(xué)相同的政策和相關(guān)待遇。?
2008年，國家林業(yè)局發(fā)布了一份文件，支持西南林業(yè)大學(xué)作為西南林業(yè)大學(xué); 2009年，國家教育部同意在西南林學(xué)院的基礎(chǔ)上建立西南林業(yè)大學(xué); 2010年3月18日，國家教育部正式同意西南林學(xué)院。更名為西南林業(yè)大學(xué); 2010年5月18日，西南林業(yè)大學(xué)正式成立。 2011年，昆明理工大學(xué)白龍校區(qū)正式移交給西南林業(yè)大學(xué)。 2013年，它被批準(zhǔn)為博士學(xué)位授予單位。

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